想请教一下基因组SNP分析基本方法和流程是？ - 知乎
Jul 2, 2024 · SNP下游分析 | 利用VCF文件进行构建系统进化树 在之前的一篇推文中，我们学会了如何使用GATK软件对测序数据（基因组测序和转录组测序均可）进行变异分析（SNP …
SNP单核苷酸多态性跟点突变有什么区别？ - 知乎
Oct 23, 2015 · SNP是单碱基多态性，是一个群体概念，这个差异占群体的1%以上。 若 germline mutation频率<1%，我们认为是一个点突变。 SNP是各种生物都有的，通过同源基因比对得 …
基因、染色体、位点、SNP 位点，都是什么，它们之间有什么关 …
基因、染色体、位点、SNP 位点，都是什么，它们之间有什么关系？ 看到23&me，感觉很好奇，于是搜索了很多文章，想知道个人基因检测是怎么玩儿的。
能否通俗地讲一讲Gene, allele, SNP的关系呀，如何理解呢？
2， SNP位置不一定在gene上，可能在基因之外的区域，也会有作用。 3， 基因型（T,A,G）不一定是来自父母，可能会自发突变，和爹妈都不一样。 rs编号里不一定包括了所有的突变类型， …
SNP (单核苷酸多态性)这个现象在生物领域可以用作什么研究，能 …
SNP（单核苷酸多态性）是生物领域中常见的遗传变异类型，指的是基因组中单个核苷酸（A、T、C、G）的变异。SNP的存在可以用于各种研究，并且可以解决许多问题，包括： 遗传疾病研 …
如何通过snp位点找到候选基因? - 知乎
一般而言，SNP定位到目标基因，需要到的文件有SNP坐标信息（例如.vcf），基因功能注释信息（一般参考基因组的就行，既基因所对应的kegg或者go注释与编号），基因组注释信息（包 …
在gwas研究中如何寻找最显著的SNP值，然后再根据这个SNP位点 …
最显著的SNP指的是P值最小的点，在GWAS研究中一般认为P<5*10-8的点是有显著关联的。 比较早的GWAS研究是直接把这些P<5*10-8拿出来作为易感位点，后来会进一步用conditional 分 …
SPN，REF/ALT? - 知乎
在单核苷酸多态性（SNP）数据库中，REF（Reference）通常表示参考序列中的碱基，即在大多数人群中被认为是“正常”或“野生型”的等位基因。ALT（Alternate）则表示与REF不同的等位基 …
遗传学中什么是SNP什么是单倍型，他们俩有什么关系? - 知乎
Jan 27, 2021 · SNP ：是指基因组上由 单个核苷酸 的变异所引起的DNA序列 多态性。 如图： 单倍型：单倍型 (haplotype)：位于一条染色体上某一区域的一组相关联的多个SNP等位位点被 …
SNP（单核苷酸多态性）的起源是什么？ - 知乎
SNP（Single Nucleotide Polymorphism）即单核苷酸多态性，这一概念首次出现于1994年发表的人类分子遗传杂志上，随后于1996年由美国麻省理工的Lander正式提出并认定其为“第三代分 …